DIAZ VANEGAS Camila (Hydroscience Montpellier, FRANCE)

First Name: Camila

Name: Diaz vanegas

Position: researcher PhD student

Email: camila.diaz@ird.fr

Institute / University / Company: Hydroscience Montpellier, Montpellier

Research Unit: Mining Pollution, Environment and Health

Address (city, state): 300 Avenue du Professeur Emile Jeanbrau, 34090 Montpellier

Country: France

Please give 5 key-words showing your research / interest in Microbial Ecotoxicolgy:

  • Bioremediation
  • Microbial ecology
  • Biogeochemistry
  • Xenobiotics
  • Bioavailability

Main kinds of contaminant(s) of interest:

  • Acid Mine Drainage (Metals and Metalloids)

Main kinds of microorganisms of interest:

  • Bacteria (particularly bacteria resisting high levels of metals and acidophilic)

Main kinds of ecosystems of interest:

  • Mining Environment
  • Aquatic ecosystems

Do you give courses on Microbial Ecotoxicology ?: NO

Most relevant articles in the field of Microbial Ecotoxicology (max.5):

I have not published yet but, I will publish soon related to my current research of arsenic and iron bioremediation.

RODRIGUE Agnès (INSA Lyon-CNRS-UCB, FRANCE)

First Name: Agnès

Name: Rodrigue

Position: Associate professor – group leader

Email: agnes.rodrigue@insa-lyon.fr

Institute / University / Company: INSA Lyon – CNRS – UCB

Research Unit: Microbiologie, Adaptation et Pathogénie – UMR5240

Address (city, state): 10 rue Dubois – 69622 Villeurbanne cedex

Country: France

Please give 5 key-words showing your research / interest in Microbial Ecotoxicolgy:

  • stress acclimatation
  • synergistic effect
  • phytopathogens
  • biosensors
  • bioremediation

Main kinds of contaminant(s) of interest:

  • metals
  • antibiotics

Main kinds of microorganisms of interest:

  • Escherichia coli
  • Pseudomonas putida
  • Citrobacter rodentium
  • Dickeya dadantii

Main kinds of ecosystems of interest:

  • soil
  • water
  • plants

Do you give courses on Microbial Ecotoxicology ?: NO

Most relevant articles in the field of Microbial Ecotoxicology (max.5):

Perrin C., Briandet R., Jubelin G., Lejeune P., Mandrand-Berthelot M.-A., Rodrigue A.*, Dorel C*. (2009) Nickel promotes biofilm formation by Escherichia coli K12 strains that produce curli. Appl. Environ. Microbiol., 75:1723-1733.

– Ray, P., Girard, V., Gault, M., Job, C., Bonneu, M., Mandrand-Berthelot, M. A., Singh, S. S., Job, D., Rodrigue, A. (2013) Pseudomonas putida KT2440 response to nickel or cobalt induced stress by quantitative proteomics. Metallomics 5 :68-79.

Gogada R, Singh SS, Lunavat SK, Pamarthi MM, Rodrigue A, Vadivelu B, Phanithi PB, Gopala V, Apte SK (2015) Engineered Deinococcus radiodurans R1 with NiCoT genes for bioremoval of trace cobalt from spent decontamination solutions of nuclear power reactors . Appl Microbiol Biotechnol. 99(21):9203-9213

– Gault M., Effantin G., Rodrigue A. (2016) Ni exposure impacts the pool of free Fe and modifies DNA supercoiling via metal-induced oxidative stress in Escherichia coli K-12. Free Radic Biol Med. 97:351-61. doi:10.1016/j.freeradbiomed.2016.06.030.

Cayron J, Prudent E, Escoffier C, Gueguen E, Mandrand-Berthelot MA, Pignol D, Garcia D, Rodrigue A. (2017) Pushing the limits of nickel detection to nanomolar range using a set of engineered bioluminescent Escherichia coli. Environ Sci Pollut Res. Int 24 :4-14 DOI 10.1007/s11356-015-5580-6.

Kassa-Laouar M, Mechakra A, Rodrigue A, Meghnous O, Bentellis A, Rached O. (2020) Antioxidative Enzyme Responses to Antimony Stress of Serratia marcescens – an Endophytic Bacteria of Hedysarum pallidum Roots. Polish Journal of Environmental studies. 29 (1): 1-12. doi: 10.15244/pjoes/100494.

EcotoxicoMic Newsletter #15 (February 2021)

The 15th EcotoxicoMic Newsletter is available:

Among others, it contains information about :

  • The next FEMS webinar that will be dedicated to Microbial Ecotoxicology (4 March)
  • The next DRomics training course (6 April)
  • The next international conference on contaminated sediments (ContaSed 2021; 9-11 June)

JUSSELME My Dung (University Paris Est Creteil, FRANCE)

First Name: My Dung

Name: Jusselme

Position: Assistant professor

Email: thi-my-dung.jusselme@u-pec.fr

Institute / University / Company: University Paris Est Creteil

Research Unit: Laboratoire Eau Environnement et Systèmes Urbains

Address (city, state): 61 avenue du Général de Gaulle

Country: France

Please give 5 key-words showing your research / interest in Microbial Ecotoxicolgy:

  • microbial diversity
  • microbial ecotoxicology
  • functional diversity
  • functional gene
  • resistance gene,

Main kinds of contaminant(s) of interest:

  • diuron
  • biocide
  • performic acid

Main kinds of microorganisms of interest:

  • bacteria
  • archaea
  • virus,

Main kinds of ecosystems of interest: aquatic and soil

Do you give courses on Microbial Ecotoxicology ?: NO

Most relevant articles in the field of Microbial Ecotoxicology (max.5): not yet

COLAS Simon (Université de Pau et des Pays de l’Adour, FRANCE)

First Name: Simon

Name: COLAS

Position: PhD Student

Email:simon.colas@univ-pau.fr

Institute / University / Company: Université de Pau et des Pays de l’Adour

Research Unit: IPREM

Address (city, state): Pau

Country: France

Please give 5 key-words showing your research / interest in Microbial Ecotoxicolgy:

  • Biomarkers
  • Biofilms
  • Toxicokinetics
  • Algal blooms

Main kinds of contaminant(s) of interest:

  • Metals
  • Polycyclic aromatic hydrocarbons
  • Cyanotoxins

Main kinds of microorganisms of interest:

  • Microalgae
  • Cyanobacteria

Main kinds of ecosystems of interest: Freshwater ecosystems

Do you give courses on Microbial Ecotoxicology ?: NO

Most relevant articles in the field of Microbial Ecotoxicology (max.5):

Colas, S., Marie, B., Lance, E., Quiblier, C., Tricoire-Leignel, H., & Mattei, C. (2020). Anatoxin-a: overview on a harmful cyanobacterial neurotoxin from the environmental scale to the molecular target. Environmental Research, 110590.

NTUMBA TSHIMANGA Simon (Institut Supérieur des Techniques Médicales, Kananga, DEMOCRATIC REPUBLIC OF CONGO)

First Name: ntumba tshimanga

Name: simon

Position: Biologiste médical au programme national de lutte contre le SIDA et les IST

Email:ntumbasimon00@gmail.com

Institute / University / Company: INSTITUT SUPERIEUR DES TECHNIQUES MEDICAL de Kananga

Research Unit: UNITE DE RECHERCHE EN MICROBIOLOGIE

Address (city, state): 04 AV.EPERON, quartier plateau,kananga, RDC

Country: République Démocratique du Congo

Please give 5 key-words showing your research / interest in Microbial Ecotoxicolgy:

  • écosystème
  • micro-symbiotes
  • environnement
  • homme
  • nourritures des poissons

Main kinds of contaminant(s) of interest:

  • Reste des denrées alimentaires
  • Déchets ménagers
  • Feuillages des différents arbres
  • Différents déchet du marché ,…..

Main kinds of microorganisms of interest:

  • Bacillus sp
  • Salmonella typhi
  • Salmonella paratyphi
  • Amibes
  • Teania saginata
  • Vibrio cholerae
  • eschericha coli
  • Donc Toutes les entérobactéries

Main kinds of ecosystems of interest:

  • étangs
  • rivières

Do you give courses on Microbial Ecotoxicology ?: YES

If yes, please tell us more about the courses (University, course level,website,etc):

Nous administrons les enseignements suivants:
1. Microbiologie générale en premier graduat de techniques de laboratoire;
2. Microbiologiste alimentaire en premier graduat de Nutrition et diététique;
3. Bactériologie systématique en prélèvements graduat de techniques de laboratoire;
4. Techniques de prélèvements en premier graduat de techniques de laboratoire;
5. Immunologie et Immunogénétique en première licence de nutrition et dietétique;
6. Mycologie générale en troissieme graduat de techniques de laboratoire.
7. Complément de mycologie en première licence de techniques de laboratoire;

Most relevant articles in the field of Microbial Ecotoxicology (max.5): not yet

LE FAUCHEUR Séverine (Université de Pau et des Pays de l’Adour, FRANCE)

First Name: Severine

Name: Le Faucheur

Position: Enseignant Chercheur

Email: severine.le-faucheur@univ-pau.fr

Institute / University / Company: Université de Pau et des Pays de l’Adour

Research Unit: IPREM

Address (city, state): Pau

Country: France

Please give 5 key-words showing your research / interest in Microbial Ecotoxicolgy:

  • Bioavailability
  • Bioindicators
  • Structural and functional responses to stress

Main kinds of contaminant(s) of interest:

  • Metals
  • Synthetic organic compounds

Main kinds of microorganisms of interest:

  • Microalgae
  • Bacteria
  • Fungi
  • Meiofauna

Main kinds of ecosystems of interest: Freshwater ecosystems

Do you give courses on Microbial Ecotoxicology ?: NO

Most relevant articles in the field of Microbial Ecotoxicology (max.5):

1. Le Faucheur S., Mertens J., Van Genderen E., Boullemant A., Fortin C. and Campbell P.G.C. (2020) Development of QICAR models to address the lack of toxicological data for technology-critical elements. Environ. Toxicol. Chem. In press.
2. Dranguet P., Slaveykova V. I. and Le Faucheur S. (2018) Kinetics of mercury accumulation by freshwater biofilms. Environ. Chem., 14, 458-467.
3. Dranguet P., Le Faucheur S., Cosio C. and Slaveykova V.I. (2017) Influence of chemical speciation and community composition on mercury accumulation by freshwater biofilms. Environ. Sci. Process. Impact. 19, 38-49
4. Dranguet P., Le Faucheur S.* and Slaveykova V.I.* (2017) Mercury bioavailability, transformations and effects to freshwater biofilms. Environ. Toxicol. Chem., 36, 3194-3205
5. Le Faucheur S., Campbell P.G.C., Fortin C. and Slaveykova V.I. (2014) Interactions between mercury and phytoplankton: speciation, bioavailability and internal handling. Environ. Toxicol. Chem. 33, 1211-1224.

ALLEN Joey ( Université de lorraine, FRANCE)

First Name: Joey

Name: Allen

Position: Post-doc

Email:joeyallen@orange.fr

Institute / University / Company: Université de lorraine

Research Unit: LIEC

Address (city, state): Metz

Country: France

Please give 5 key-words showing your research / interest in Microbial Ecotoxicolgy:

  • microbial interactions
  • biofilms
  • microalgae
  • decomposers

Main kinds of contaminant(s) of interest:

  • pesticides
  • multiple stressors

Main kinds of microorganisms of interest:

  • microalgae
  • diatoms
  • filamentous algae
  • aquatic fungi

Main kinds of ecosystems of interest: aquatic ecosystems

Do you give courses on Microbial Ecotoxicology ?: NO

Most relevant articles in the field of Microbial Ecotoxicology (max.5):

ALLEN, Joey, GROSS, Elisabeth M., COURCOUL, Camille, et al. Disentangling the direct and indirect effects of agricultural runoff on freshwater ecosystems subject to global warming: A microcosm study. Water Research, 2021, vol. 190, p. 116713.

DHOMMEE Roxane (Université Clermont Auvergne, FRANCE)

First Name: Roxane

Name: Dhommée

Position: PhD. Student

Email:roxane.dhommee@uca.fr

Institute / University / Company: Université Clermont Auvergne

Research Unit: Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE) et Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF)

Address (city, state): Campus Universitaire des Cézeaux, 1 Impasse Amélie Murat, TSA 60026, 63178 Aubière Cedex

Country: France

Please give 5 key-words showing your research / interest in Microbial Ecotoxicolgy:

– Organic Pollutants
– Biodegradation
– Degrading-strain isolation
– Identification of biodegradative pathways
– Bioremediation

Main kinds of contaminant(s) of interest:

Pesticides (Nicosulfuron and its degradation by-products (ASDM, ADMP), 2,4-D, …)

Main kinds of microorganisms of interest:

– Bacteria, archaea, fungi

Main kinds of ecosystems of interest: Soils

Do you give courses on Microbial Ecotoxicology ?: NO

Most relevant articles in the field of Microbial Ecotoxicology (max.5): Not yet

Appel à candidatures Docs et Post-Docs

Le réseau EcotoxicoMic se veut être au service des jeunes chercheurs en écotoxicologie microbienne, afin notamment de les aider à valoriser leurs travaux et à se constituer un réseau national et international dans cette thématique de recherche.

Dans ce contexte, nous lançons un appel à candidatures auprès des doctorant(e)s et post-docs francophones pour :

i) rejoindre le comité de pilotage (COPIL) du réseau
et/ou

ii) s’impliquer dans l’organisation d’un séminaire scientifique international organisé par et pour les doctorants/post-doctorants au cours de l’automne 2021 (dans un format virtuel).

Concrètement, en quoi consistent les missions proposées?
– concernant le COPIL EcotoxicoMic, il s’agit de participer à deux ou trois réunions par an (avec ~25 scientifiques francophones représentants différents instituts et universités) afin de prendre part aux échanges et réflexions concernant les actions menées (ou à mettre en place) par le réseau, en apportant votre regard de jeune chercheur (le prochain COPIL aura lieu juste avant les vacances d’été).

– concernant l’organisation du séminaire scientifique international docs et post-docs, il s’agit d’intégrer un comité constitué de doctorant(e)s et de Post-doctorants qui sera en charge de programmer, mettre en place et animer ce séminaire (choix des dates et du format, définition du programme scientifique, appel à contributions et sélection des résumés…) avec l’aide de trois chercheurs du réseau (Aurélie Cébron, Abdulsamie Hanano et Stéphane Pesce) et les membres de la Fondation Rovaltain qui soutient celui-ci (https://fcsrovaltain.org/).

Ces missions peuvent enrichir votre expérience de jeune chercheur(e) et vous permettre de découvrir le fonctionnement d’un réseau scientifique international et/ou l’organisation d’une manifestation scientifique.

Vous êtes intéressé(e) par l’une et/ou l’autre de ces missions ou vous souhaitez en savoir plus à ce sujet?  N’hésitez pas à prendre contact (stephane.pesce@inrae.fr).

Nous comptons sur vos candidatures pour le 26 février!